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來源: 發布時間:2023-11-30

逆轉錄常見問題及解決方法之RNA濃度不高:a)、原始組織樣本或細胞量太少:提高加入量。b)、RNA發生降解:如果使用者確定提取RNA的試劑/器具沒有問題,RNA的降解通常發生在樣品破碎/勻漿階段。有兩個辦法可以徹底抑制內源RNase活性:1.立即加入裂解液并且徹底而迅速地勻漿。這只適合培養細胞及內源RNase含量較低的并且較容易勻漿的組織,2.對于內源RNase含量高或不易勻漿的組織,如肝臟、胰腺、脾臟、肌肉等,或植物組織,需要切成小塊后立即投入液氮冷凍,再按說明進行破碎/勻漿。c)、加入異丙醇后室溫沉淀10min或-20C冰沉淀30min即可,無需過夜沉淀。逆轉錄實驗前應對所有器具和實驗臺面消毒和清潔,避免交叉污染影響實驗結果。上海一步法逆轉錄生產廠家

逆轉錄實驗過程中要注意RNA樣品的保存、純化、處理和轉錄酶的選擇,逆轉錄實驗前要對反應體系進行無RNA和無反轉錄酶的對照。多逆轉錄酶都具有多種酶活性,主要包括以下幾種活性。①RNA指導的DNA聚合酶活性;以RNA為模板,催化dNTP聚合成DNA的過程。此酶需要RNA為引物,多為色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反轉錄酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此沒有校正功能,所以由反轉錄酶催化合成的DNA出錯率比較高。②RNaseH活性;由反轉錄酶催化合成的cDNA與模板RNA形成的雜交分子,將由RNaseH從RNA5′端水解掉RNA分子。上海一步法逆轉錄生產廠家逆轉錄實驗過程中避免光照,防止RNA樣品和試劑受光降解或刺激。

逆轉錄過程是病毒的復制形式之一,如RNA病毒中的逆轉錄病毒,DNA病毒中的擬逆轉錄病毒的復制均需要經過逆轉錄。逆轉錄過程在真核細胞中也同樣存在,例如逆轉座子和端粒DNA的延長均存在逆轉錄過程,需逆轉錄酶的催化,端粒酶即為真核細胞中的逆轉錄酶。逆轉錄過程的揭示是分子生物學研究中的重大發現,是對中心法則的重要修正和補充。人們通過體外模擬該過程,以樣本中提取的mRNA為模板,在逆轉錄酶的作用下,合成出互補的cDNA,構建cDNA文庫,并從中篩選特異的目的基因。該方法已成為基因工程技術中較常用的獲得目的基因的策略之一。

miRNA逆轉錄莖環法:首先需要進行RNA樣品制備,可選的方法有:離心柱法抽提(不必去除gDNA);傳統Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分別設計。是否采用通用引物視情況而定,正向引物與通用反向引物不會形成二聚體時才能用。取200ul的PCR管,根據所得每組RNA的濃度C,每孔加入1000ng總RNA,按公式1000ng/C計算出所需RNA的體積x。然后按建議的20μL反應體系說明,依次向200μL的PCR管內加入下列試劑:加樣結束后,移液器吹打混勻,低速離心數秒。將逆轉錄PCR管放入PCR擴增儀內,調整參數:37℃15min(反轉錄反應),85℃5s(反轉錄酶的失活反應),4℃∞。反應結束后根據實驗需要進行熒光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。說明:此處可以選擇U6下游引物作為U6的逆轉錄引物,注意相應地調整無酶水的體積和反應溫度。逆轉錄在研究RNA表達調控等領域有普遍的應用前景。

逆轉錄酶實驗流程:從細胞材料中提取RNA→RNA加入到含有逆轉錄酶、引物、dNTPs的反應體系中→退火,引物與RNA鏈配對→延伸,逆轉錄酶合成互補cDNA鏈變性→常規PCR反應流程(變性、退火、延伸,如此多次循環)。RT-PCR“兩步法”與“一步法”RT-PCR的實驗操作分為“一步法”與“兩步法”兩種。一步法RT-PCR能克隆微量mRNA而不需構建cDNA文庫(即cDNA合成與PCR反應在同一Buffer及酶中進行,一步法完成),省略了cDNA與PCR之間的過程。兩步法RT-PCR首先用反轉錄酶合成cDNA,然后以cDNA為模板進行PCR,即RNA反轉錄與PCR擴增分兩步進行。逆轉錄現象說明:至少在某些生物中,RNA同樣兼有遺傳信息傳遞和表達功能。miQP2逆轉錄公司

逆轉錄反應首先需要逆轉錄酶的反應活性。上海一步法逆轉錄生產廠家

逆轉錄PCR的用途普遍,可用于分析基因的轉錄產物、檢測細胞中RNA病毒的含量、合成cDNA探針、直接克隆特定基因的cDNA序列等。如在臨床上RT-PCR可以用于遺傳病診斷、病癥檢測、檢測病人標本中的RNA病毒,如HAV、HCR、HIV等。在植物方面RT-PCR常用于研究環境脅迫對植物基因表達的影響,以及在特定的環境或生長階段中植物體不同部位基因表達的差異性。使用RT-PCR檢測分析RNA轉錄產物具有以下突出的優點:理論上可以檢測幾乎任何基因的轉錄產物;可以實現極為微量RNA樣品(ng級別)的檢測;樣品耐受性好,未經純化的粗制生物樣品也可以用于檢測。上海一步法逆轉錄生產廠家

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